MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_78p

Total Repeats: 1863

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018879	T	6	6	9	14	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018879	AT	3	6	173	178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018879	TAT	2	6	180	185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018879	TAAA	2	8	198	205	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018879	AATA	2	8	207	214	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018879	ATACAT	2	12	215	226	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_018879	AAC	2	6	272	277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018879	TTC	2	6	283	288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018879	AT	3	6	377	382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018879	TAA	2	6	412	417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018879	CAA	2	6	467	472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018879	CAT	2	6	484	489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018879	TAA	2	6	544	549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018879	TG	3	6	556	561	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018879	GGGA	2	8	642	649	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018879	GCCT	2	8	715	722	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_018879	G	6	6	759	764	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018879	ATA	2	6	765	770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018879	AGA	2	6	892	897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018879	T	6	6	921	926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018879	GCC	2	6	987	992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_018879	T	7	7	1045	1051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018879	TC	3	6	1097	1102	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_018879	ATTT	2	8	1121	1128	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018879	TAAT	2	8	1152	1159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018879	CAA	2	6	1206	1211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018879	ATT	2	6	1278	1283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018879	T	7	7	1282	1288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018879	AAAT	2	8	1385	1392	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018879	ATTT	2	8	1400	1407	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018879	TTC	2	6	1448	1453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018879	T	6	6	1505	1510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018879	AATA	2	8	1602	1609	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018879	GGT	2	6	1647	1652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018879	GTAT	2	8	1655	1662	25 %	50 %	25 %	0 %	410678639
36	NC_018879	A	6	6	1723	1728	100 %	0 %	0 %	0 %	410678639
37	NC_018879	ATAA	2	8	1753	1760	75 %	25 %	0 %	0 %	410678639
38	NC_018879	A	6	6	1839	1844	100 %	0 %	0 %	0 %	410678639
39	NC_018879	TCT	2	6	1913	1918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678639
40	NC_018879	TGA	2	6	2028	2033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678639
41	NC_018879	GAAA	2	8	2112	2119	75 %	0 %	25 %	0 %	410678639
42	NC_018879	TGG	2	6	2271	2276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410678639
43	NC_018879	ATA	2	6	2300	2305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678639
44	NC_018879	GAACA	2	10	2330	2339	60 %	0 %	20 %	20 %	410678639
45	NC_018879	GAA	2	6	2500	2505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678639
46	NC_018879	TCA	2	6	2553	2558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678639
47	NC_018879	AT	3	6	2770	2775	50 %	50 %	0 %	0 %	410678639
48	NC_018879	ACA	2	6	2802	2807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678639
49	NC_018879	AGA	2	6	2838	2843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678639
50	NC_018879	A	6	6	2851	2856	100 %	0 %	0 %	0 %	410678639
51	NC_018879	TA	3	6	2933	2938	50 %	50 %	0 %	0 %	410678639
52	NC_018879	GAA	2	6	2944	2949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678639
53	NC_018879	CAA	2	6	2957	2962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678640
54	NC_018879	AAC	2	6	2965	2970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678640
55	NC_018879	TTAAAA	2	12	2984	2995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678640
56	NC_018879	TAA	2	6	3037	3042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678640
57	NC_018879	ATTC	2	8	3113	3120	25 %	50 %	0 %	25 %	410678640
58	NC_018879	AGG	2	6	3153	3158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410678640
59	NC_018879	TGA	2	6	3160	3165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678640
60	NC_018879	TAA	2	6	3193	3198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678640
61	NC_018879	ACA	2	6	3199	3204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678640
62	NC_018879	CAA	2	6	3239	3244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678640
63	NC_018879	GTG	2	6	3270	3275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410678640
64	NC_018879	AGC	3	9	3310	3318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410678640
65	NC_018879	TTATT	2	10	3337	3346	20 %	80 %	0 %	0 %	410678640
66	NC_018879	TTA	2	6	3438	3443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678640
67	NC_018879	TGA	2	6	3445	3450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678640
68	NC_018879	GGA	2	6	3475	3480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410678640
69	NC_018879	ATT	2	6	3487	3492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678640
70	NC_018879	GTA	2	6	3525	3530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678640
71	NC_018879	CAT	2	6	3620	3625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678640
72	NC_018879	GGT	2	6	3631	3636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410678640
73	NC_018879	TGAT	2	8	3688	3695	25 %	50 %	25 %	0 %	410678640
74	NC_018879	CAT	2	6	3811	3816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678641
75	NC_018879	AT	3	6	3843	3848	50 %	50 %	0 %	0 %	410678641
76	NC_018879	T	7	7	3910	3916	0 %	100 %	0 %	0 %	410678641
77	NC_018879	TAA	2	6	3918	3923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678641
78	NC_018879	GATT	2	8	3924	3931	25 %	50 %	25 %	0 %	410678641
79	NC_018879	TCA	2	6	3951	3956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678641
80	NC_018879	A	7	7	3968	3974	100 %	0 %	0 %	0 %	410678641
81	NC_018879	CTT	2	6	3988	3993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678641
82	NC_018879	ATTT	2	8	4051	4058	25 %	75 %	0 %	0 %	410678641
83	NC_018879	AAG	2	6	4114	4119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018879	ATTA	2	8	4175	4182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018879	ATA	3	9	4199	4207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018879	ATATT	2	10	4213	4222	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018879	TAC	2	6	4274	4279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678642
88	NC_018879	TTC	2	6	4290	4295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678642
89	NC_018879	TAT	2	6	4356	4361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678642
90	NC_018879	TAA	2	6	4428	4433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678642
91	NC_018879	AAATA	2	10	4453	4462	80 %	20 %	0 %	0 %	410678642
92	NC_018879	A	7	7	4499	4505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018879	A	7	7	4521	4527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018879	TTCT	2	8	4533	4540	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_018879	T	6	6	4565	4570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018879	TGA	2	6	4582	4587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678643
97	NC_018879	T	6	6	4618	4623	0 %	100 %	0 %	0 %	410678643
98	NC_018879	AGTA	2	8	4679	4686	50 %	25 %	25 %	0 %	410678643
99	NC_018879	ACG	2	6	4739	4744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410678643
100	NC_018879	TCA	2	6	4791	4796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678643
101	NC_018879	TAA	2	6	4822	4827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678643
102	NC_018879	AGC	2	6	4828	4833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410678643
103	NC_018879	ACA	2	6	4846	4851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678643
104	NC_018879	ACT	2	6	4864	4869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678643
105	NC_018879	TCT	2	6	4901	4906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678643
106	NC_018879	CGTATT	2	12	4928	4939	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410678643
107	NC_018879	AGG	2	6	4996	5001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410678643
108	NC_018879	TTCATA	2	12	5064	5075	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	410678643
109	NC_018879	ACA	2	6	5089	5094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678643
110	NC_018879	TG	3	6	5115	5120	0 %	50 %	50 %	0 %	410678643
111	NC_018879	AT	3	6	5188	5193	50 %	50 %	0 %	0 %	410678643
112	NC_018879	CTA	2	6	5209	5214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678643
113	NC_018879	TC	3	6	5217	5222	0 %	50 %	0 %	50 %	410678643
114	NC_018879	AC	3	6	5235	5240	50 %	0 %	0 %	50 %	410678643
115	NC_018879	GTAT	2	8	5241	5248	25 %	50 %	25 %	0 %	410678643
116	NC_018879	A	7	7	5250	5256	100 %	0 %	0 %	0 %	410678643
117	NC_018879	ATT	2	6	5268	5273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678643
118	NC_018879	GAA	2	6	5283	5288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678643
119	NC_018879	TA	3	6	5306	5311	50 %	50 %	0 %	0 %	410678643
120	NC_018879	AGAT	2	8	5313	5320	50 %	25 %	25 %	0 %	410678643
121	NC_018879	GAAT	2	8	5385	5392	50 %	25 %	25 %	0 %	410678643
122	NC_018879	AACAA	2	10	5428	5437	80 %	0 %	0 %	20 %	410678643
123	NC_018879	CAA	2	6	5441	5446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678643
124	NC_018879	A	7	7	5475	5481	100 %	0 %	0 %	0 %	410678643
125	NC_018879	GTA	2	6	5505	5510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678643
126	NC_018879	TA	3	6	5532	5537	50 %	50 %	0 %	0 %	410678643
127	NC_018879	TTTA	2	8	5614	5621	25 %	75 %	0 %	0 %	410678643
128	NC_018879	TCA	2	6	5647	5652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678643
129	NC_018879	ATTG	2	8	5701	5708	25 %	50 %	25 %	0 %	410678643
130	NC_018879	TTC	2	6	5722	5727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678643
131	NC_018879	CTC	2	6	5753	5758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410678643
132	NC_018879	GAA	2	6	5761	5766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678643
133	NC_018879	A	6	6	5765	5770	100 %	0 %	0 %	0 %	410678643
134	NC_018879	AT	4	8	5795	5802	50 %	50 %	0 %	0 %	410678643
135	NC_018879	TCT	3	9	5818	5826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678643
136	NC_018879	TCT	2	6	5887	5892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678643
137	NC_018879	A	7	7	5927	5933	100 %	0 %	0 %	0 %	410678643
138	NC_018879	AT	3	6	5943	5948	50 %	50 %	0 %	0 %	410678643
139	NC_018879	A	6	6	5996	6001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018879	A	6	6	6064	6069	100 %	0 %	0 %	0 %	410678644
141	NC_018879	TAA	2	6	6178	6183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678644
142	NC_018879	TCA	2	6	6209	6214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678644
143	NC_018879	CA	3	6	6245	6250	50 %	0 %	0 %	50 %	410678644
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